（一）走上领导岗位
出任边区保安司令
1937年5月15日，中共陕甘宁边区召开第一次党代表大会，高岗没有参加这次会议，但他却获得全票，当选为边区党委的17位执行委员之一，并在党中央未提名的情况下，全票当选为边区党委书记。尽管当时党中央还是任命郭洪涛为边区党委书记，可是缺席获全票的事引起了党中央和毛泽东的重视，不久，高岗被任命为中央少数民族工作委员会书记。
“七·七”事变后，根据国共两党协议，8月下旬将红军主力部队改编为八路军，总共只有三万多人，6其余的红军都改编为八路军留守部队（保卫党中央、陕甘宁）和地方部队。9月，将陕甘宁苏维埃政府改为陕甘宁边区政府（辖三省的23个县），高岗为边区政府主席团委员之一。随后成立了陕甘宁边区保安司令部，高岗任保安司令。11月，任八路军骑兵司令，率骑兵团到三边7及其北部一带，联合蒙族同胞开展剿匪和抗日游击活动。
高岗在反省时说：“我不知道边区党代会上我得了全票。中央调我回来，我还以为又犯错误了，对人家说，这次回家凶多吉少。回来以后才知道是党代会得了全票。先在毛主席那里（中央军区）做一局局长，后来当保安司令。”
当时边区的形势十分险恶：一方面是山西的日军不断侵犯黄河河防，轰炸和炮击河西的城镇；一方面是国民党30万军队的重重包围，对边区实行军事、经济封锁。国民党顽固派不断制造摩擦，唆使边区的反动势力捣毁抗日组织、攻击抗日军政机关、杀害我工作人员及群众；并调集数十万军队先后向陕甘宁边区发动了三次较大规模的进攻，妄图消灭边区。同时，在边区内部，匪患严重（其中三边地区张廷芝是被我打散的国民党残部，流窜为匪），成为边区的心腹之患。
高岗上任后，根据毛泽东在洛川会议提出的“保存和扩大红军”的任务，8立即着手对陕甘宁边区的地方部队和自卫军进行整编。
首先，将原有的地方部队、游击队和警卫部队改组编为保安部队，将边区划分为若干警备区，设立警备司令部，明确各保安部队的驻守区域和任务，加强思想政治教育和军事训练，提高其政治军事素质和战斗力，配合八路军留守部队担负保卫陕甘宁边区和党中央的重任，随时准备参加主力部队，开赴抗日前线。
第二，将原有的赤卫军改编为抗日自卫军，明确自卫军的性质是“半军事性质的群众性抗日武装组织，同时是抗日的后备军”。其任务是，平时生产练兵、维护社会秩序，战时配合主力部队作战，担负战勤任务。到1938年底，边区从村到乡、县都建立了抗日自卫军。
保安部队紧紧依靠边区人民，坚持“人不犯我，我不犯人；人若犯我，我必犯人”的原则，坚决反击国民党顽固派的摩擦，粉碎其三次反共高潮和对白区党疯狂进攻；改造了旧政权和旧保安队，巩固了抗日民主政权。同时，高岗亲率保安部队，在八路军留守兵团的配合下，经过两年反复清剿，先后剿匪40多股，彻底肃清了边区的匪患。他后来回忆说：“去三边打土匪，认为自己还不错，三个月就肃清了。其实这是党中央、留守兵团、群众的力量。”
保安部队和自卫军还积极配合主力部队保卫千里河防，动员大批人力、畜力渡河支援山西抗日战场。高岗亲自沿河视察，慰问守防阵地官兵；到野战医院和沿途兵站看望慰问伤病员，了解部队的伙食与医疗情况，勉励伤病员安心治疗；要求医护人员和驻地的群众像对亲兄弟一样护理好伤病员。
1942年5月，中央军委决定成立陕甘宁晋绥联防司令部，保安部队编入正规部队，由联防司令部统一指挥。贺龙任司令员，高岗任副政委。因政委关向应生病，由高岗代行政委职。此时，陕甘宁边区的总兵力达四万余人。
走上党政领导岗位
1938年4月，党中央决定改组边区党委，任命高岗为陕甘宁边区党委书记。
他初涉边区领导工作没有经验，遇到不少问题，产生过畏难情绪。正如他所说：“边区党委的工作很难搞，心想：‘边区麻烦，不如当地委书记，挑大粪也好’，‘去他妈的，不如去挑大粪’”
党中央派了大批有经验的干部到边区工作，手把手地教他，才逐步成熟起来。1938年11月，中央成立西北工作委员会，高岗是委员之一。1941年5月，他出任西北局书记，主持全面工作。1946年，他又连任第三届边区参议会议长。⒀
注131946年4月召开边区第三届参议会一次会议时，高岗虽然已经调到东北工作，但仍当选为陕甘宁边区参议会议长。
在党中央的领导和培养下，高岗的工作获得了全面丰收，他本人也获得了很高的荣誉。1945年党的“七大”期间，他当选为中共中央委员和中央政治局委员。
高岗的这段历史，就是人们所说的“西北起家”。
然而，他在工作中，往往不能正确处理各方面的关系，在反省时，不无愧疚地说：“1938年到边区党委。过去肃反，王明、郭洪涛是错误的。现在自己做了保安司令，做了书记，如果更谦虚谨慎，和不同意见的干部一起工作，那就好了。可是自己的能力是不成熟的，我却觉得仇恨，很狭隘。”
