王室：人狗混合献祭与头盖骨加工
到郑州商城三期，宫殿区出现了人和狗的混合祭祀。
宫殿区东北侧150米处，有一片以“神石”为崇拜对象的祭祀 场：场地中心直径5米范围内，有几块扁平的红色砂石块，其中三块 堆在一起，最大的一块高约30厘米（底部埋入地下），宽约45厘米， 厚约15厘米，犹如一块扁平石碑；在西南侧，另有三块列成一条线。 发掘报告将其称为“埋石”，认为它们是接受祭祀的对象。
环绕着这些红石块，有多座埋有狗和人的尸骨的祭祀坑，其中， 埋狗坑八座，里面重叠埋入大量完整的狗骨骼，有些狗的腿呈捆绑挣 扎状，其中两座坑的底部有散碎人骨以及完整的人骨架两具。多数坑 未发掘到底，用狗总量估计应该会超过一百只。
有一座狗坑还出土了一件黄金薄片夔纹饰物，可能是目前发现的 中国最早的黄金工艺品。在这座狗坑的外侧，则有14座各埋一人的坑， 都极为狭窄，人是勉强塞进去的，没有随葬品，有的手脚呈捆绑状。 和狗一样，他们也是献给“神石”的祭品。
“神石”东西两侧各有一座五边形土坑，相隔1米多，坑内堆积 着深灰色的油腻灰烬，坑壁呈灰黄色，且含有大量油脂，“手触异常 光滑”，可能是主祭者割取狗和人牲的油脂在坑中焚烧“燎祭”所致。
在这之前的夏商遗址中，很少看到这种大量用狗和人共同献祭的 场景，但稍晚的殷商阶段的铜山丘湾（今徐州市北郊）有一片埋狗和 人的祭祀场，场地中心也是几块堆积的大石头。至于这种风俗源自何 处，丘湾和郑州之间是什么关系，还有待更多的考古发现来印证。
此外，郑州商城宫殿区曾兴建过多座大型夯土建筑，到三期时， 建筑被废弃，在地基上挖了一条南北走向的壕沟，宽2米，里面堆积 和掩埋了大量的人头盖骨。壕沟东壁有三个南北走向的柱洞，柱洞之 间相距1米多，地面上有很多生活垃圾和加工骨器的残余物，还有很 少见的青铜簪以及玉簪和玉铲。据推测，沟的东侧可能有一座工棚。
从这些迹象看，壕沟东侧工棚区并非生产某种特定的产品，而 是给宫殿区用户随时加工和改制各种生活用品，也可称为“修理区”。 头盖骨应当也是在工棚内加工的，但不知出于什么原因，又堆积到了 旁边的壕沟中。
沟内头盖骨从南到北堆成三堆，北堆和中堆相对完整，南堆残破, 可能有人为破坏。有四十多枚头盖骨出土时较完好。没有发现人体其 他部位的骨头。
这些头骨的加工方式是：沿着眼眶和耳孔部位锯开，只保留碗状 的头盖骨部分，再用石头把锯割面打磨光滑。没有发现锯下来的面骨、 下颗骨和牙齿等，看来工棚内有分拣处理程序，无用的残骨被运到了 别处。
经鉴定，这些头骨均来自男性，主要是青年，也有少量中年和少 年的。和人头骨堆在一起的，有一具带两角的牛头骨。从照片看，有 些头骨上好像存在人为的凿孔，但发掘报告没有对此加以详细介绍。 目前，商朝只发现这一处批量加工头骨的遗迹。有学者认为，它们是 “饮器”，有原始宗教用途，可能是充当某种巫术法器。10
头骨堆积照片以及两件头骨的锯痕线图
这些头盖骨被扔进即将填平的壕沟，然后加以掩埋，显然是遗弃 物。但是，它们当中很多都是完好的、经过加工的碗状头骨，而且这 条沟也不是抛弃废骨料的场所。这很可能跟郑州商城三期末尾的一场 大动荡和风俗变革有关。
在三期的繁荣阶段，宫殿区的头骨制作场并不是特例。郑州的 商人还会用人骨制作生活用具，比如，商城北墙外的紫荆山北侧就 有一座骨器作坊，从郑州商城二期开始运营，最初只用兽骨，到三 期大量出现用人骨加工制作骨器的现象：先把人的肢骨两端的骨臼 锯掉，只留下中段骨管，再锯成约8厘米长的骨条，用来磨制骨簪、 骨链或骨针。
这片制骨作坊区因被河南省多家省直单位的建筑覆压，考古发掘 工作只能见缝插针。目前，已经发现很多制骨半成品和废骨料，没有 发现头骨，而隔着仅仅1公里多的宫殿区内，则只有人头盖骨。
除了王室高层，郑州商城三期的普通族邑也大量用人献祭。比如， 在南城外的铸铜场就发现了两座祭祀坑:M172,南北正向，长方形坑， 东侧紧挨着铸铜操作区，形状像一个标准墓穴，坑底并列埋着四具成 年人骨架，头朝正北方，有三具上半身已腐朽。发掘报告推测，“似 为杀死后依次并列放入坑中”；M167,造型与M172类似，也埋着四 具成年人骨架，多数骨骼已腐朽。
此外，商城内外还有很多零散分布的祭祀坑：西城外曾发现四座 牛祭坑，每座埋入一头牛；城外西南角发现一座较深的坑，在深约3 米处埋有两具男子尸骨，骨架不完整，发掘报告推测，“可能与举行 祭祀后的杀殉有关”。
